聖路加堂舊址係租用花蓮市福建街的一間民房，是本教區第二任主教龐德明主教任內於主曆1977年11月30日聖安得烈日所奉獻的聖堂。
1979年7月25日龐主教按立尉森大夫為會吏，為本堂首位聖職人員，1980年主教委員會決議購買明心街現址建堂。
1981年11月23日新堂落成啟用由龐主教及第三任主教張培揚主教共同主禮。
1984年陳宏行會長就任堂牧為本堂首位駐堂牧師。
1985年9月16日杜榮哲會長接任本堂主禮聖品，1986年購置現址一樓及地下室。
1989年1月8日李文惠會長接任堂牧，同年8月1日李文惠會長調任聖三一堂。本堂由第四任主教簡啟聰主教兼管，1990年派任鮑劍光會吏駐堂協助。
1994年12月27日廖金陵會長接任堂牧，1998年獲UTO捐款200萬元進行改建重新裝修。
1999年2月1日陳宏行會長第二次接任本堂堂牧。
2002年1月26日李以諾會長接任堂牧。
2003年魏斐然會長任代理堂牧至2004年2月，之後由信徒領袖分擔聖工。
2005年派任陳致仁傳道駐堂協助堂務並由陳德沛會長指導。
2009年3月委派吳明龍會吏為福傳主任，2012年4月吳會吏被按立為會長，5月委派吳牧師為主理聖品，7月吳會長轉任為全時聖職，並於7月22日就任堂牧。
2018年9月委派何睿恩會長接任堂牧。2020年底開始討論整修事宜，2021年初開工，2021年4月1日完工。
2022年7月31日委任梁凡偉會長為駐堂牧師，繼續花蓮地區的福傳工作。
